用于在NGS前,定量、定性检测可扩增DNA
Features
在Array或单独的反应管中实施定性或定量类PCR分析
对PCR扩增后的DNA进行定性和定量
指导靶向富集条件的优化
无需进行梯度稀释
Product Details
GeneRead DNA QuantiMIZE System是基于qPCR方法的检测系统,适于在NGS分析之前对即将进行靶向富集扩增的DNA进行定量与定性分析。本系统专为探索型、转化型和临床型等不同类型的研究人员而研发。这一类人员往往面对的是分离自包括FFPE等不同生物样本的DNA,需要更为经济、高效的检测手段来确定靶向富集DNA的最优条件。不同于其他技术手段,此系统不仅能够对可扩增的DNA进行定量,还能同时优化靶向富集条件,从而提升NGS检测的成功率。
Performance
通过GeneRead DNA QuantiMIZE System对可扩增的DNA进行定量和定性操作,能够成功从低质量的FFPE样本中获得有效样本进入后续的NGS分析。使用GeneRead DNA QuantiMIZE System可获得高质量的文库,进而在MiSeq设备上成功实施测序。
Principle
GeneRead DNA QuantiMIZE System应用了两类qPCR分析,能够对20个基因组位点进行查询以确定生物样本中可扩增DNA的数量。这两类分析——即Assay 100和Assay 200——能够分别生成100和200 bp的扩增子。QuantiMIZE Kit使用Assay 100和Assay 200分析中获得的CT值来同时为对照(Control)样本和检测(Case)样本的DNA进行定量和定性。
Procedure
将生物样本中抽提出的基因组DNA与所提供的预混液进行混合。如果使用了芯片试剂盒,则将混合之后的样品平均加样至芯片当中;如果使用了分析试剂盒,则在加样至芯片之前将其与Assay 100和Assay 200进行混合。执行PCR反应并将原始的CT值导出至网络数据分析模块当中,后者将对DNA进行定量和定性,并提供所需的DNA数量和PCR循环数方面的指导意见,以帮助优化靶向富集条件。
Applications
GeneRead DNA QuantiMIZE Kit适合于针对任何种类DNA样本进行定量和定性操作。其尤为适于FFPE等低质量DNA样本。不仅如此,为了成功地实施靶向富集操作,此试剂盒还能够针对任何种类的DNA样本中的基因组区域,进行条件优化方面的必要工作;其所兼容的DNA样本囊括了FFPE等低质量DNA样本和细针吸取液等低含量DNA样本。