从植物组织中制备基因组DNA较常采用的方法有氯化离心法、CTAB抽提法等。CTAB是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中,CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,但不会沉淀核酸。再通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后,加入乙醇沉淀,即可使核酸分离出来。
储存温度:室温(15℃-25℃) 干燥保存
产品组成:
2×CTAB 提取缓冲液成分:2%(w/v)CTAB,100mM Tris (pH 8.0),20mM EDTA, 1.4 M NaCl,,还原剂(随用随加) 。
实验操作步骤:
一 DNA提取:
1. 2×即用型CTAB提取液配制:按照终浓度0.2% (v/v)加入还原剂,如1 ml 2×CTAB提取缓冲液中加入2 μl还原剂。2×即用型CTAB提取液建议现用现配。
2. 材料研磨:取0.2-0.5克新鲜植物材料,于液氮中研磨成粉末。
3. 样品裂解:按照每100 mg研磨粉末使用0.5 ml提取缓冲液的比例将粉末转入1.5 ml离心管中,立即加入65℃预热的2×即用型CTAB提取缓冲液,65℃水浴30分钟,间歇混匀。
注:提取缓冲液使用量不要超过0.7 ml,否则后续纯化不能在一个离心管内完成;CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
4. 离心去杂质:14000 g 常温离心5分钟,转移上清至新的1.5 ml离心管中。
5. 去除RNA:上清中加入1/100上清体积的RNaseA溶液(10 mg/ml)(货号:RN001),如500 μl上清中加如5 μl RNaseA溶液,37℃处理20分钟。
6. 第一次抽提纯化:
6.1 步骤5溶液中加入等体积的DNA抽提溶液I(25:24:1)(货号:PC1015),轻缓颠倒离心管混匀8-10次,常温14000 g 离心10分钟,保留上清。
6.2. 重复抽提一次。
7. 第二次纯化:上清中加入等体积核酸抽提溶液(24:1)(货号:PC1017),颠倒离心管混匀8-10次,常温14000 g离心10分钟,保留上层水相。
8. 沉淀DNA:
8.1 将上层水相转入新的1.5 ml离心管中,加入0.6倍体积的冰冷异丙醇,轻柔混匀,-20℃静置30分钟;
8.2 14000 g4℃离心10分钟。
9. 漂洗DNA:
9.1 去上清液, 加入1ml 70%乙醇漂洗沉淀,4℃14000 g 3分钟,吸弃乙醇。
9.2 4℃ 14000 g 1分钟,用移液器吸尽残余乙醇,超净台吹干沉淀。
注:沉淀不能彻底干燥,否则不好溶解。
10. 贮存DNA:加入50-100 μl的超纯水或TE缓冲液(货号:TE1050)溶解DNA,-20℃保存备用。
二 RNA提取:
注:以下程序请注意所有试剂都要保证RNase-free。
1. 2×即用型CTAB提取液(RNase-free)(货号:RTG2405F)配制(现用现配):2×CTAB提取缓冲液中按照1/1000体积加入DEPC,如100 ml中加入100 μl DEPC,混匀后过夜处理,高温高压,即为2×即用型CTAB提取缓冲液(RNase-free)。按照终浓度1 % (v/v)加入还原剂,如1 ml 2×CTAB提取缓冲液(RNase-free)中加入10 μl还原剂。2×即用型CTAB提取液建议现用现配。
2. 材料研磨:取0.2-0.5克新鲜植物材料,于液氮中研磨成粉末。
3. 样品裂解:按照每100 mg研磨粉末使用0.5 ml提取缓冲液的比例将粉末转入1.5 ml离心管中,立即加入65℃预热的2×即用型CTAB提取缓冲液,65℃水浴30分钟,间歇混匀。
注:提取缓冲液使用量不要超过0.7 ml,否则后续纯化不能在一个离心管内完成;CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
4. 离心去杂质:14000 g 常温离心5分钟,转移上清至新的1.5 ml离心管中。
5. 第一次纯化:上清中加入等体积的RNA抽提溶液I(25:24:1)(货号:PC1018),轻缓颠倒离心管混匀8-10次,常温14000 g 离心10分钟。
6. 第二次纯化:将上清液转入另一1.5 ml离心管中,加入等体积核酸抽提溶液(24:1)(货号:PC1017),颠倒离心管混匀8-10次,常温14000 g离心10分钟。
7. 沉淀RNA:将上层水相转入新的1.5 ml离心管中,加入1/2体积7.5 M LiCl(RNase-free)(货号:LC1030),轻柔混匀,-20℃ 静置30分钟;14000 g4℃离心10分钟。
9. 漂洗RNA:
9.1 去上清液, 沉淀中加入1ml 70%乙醇(RNase-free),吹打漂洗沉淀,14000 g4℃3分钟,吸弃乙醇。
9.2 14000 g4℃1分钟,用移液器吸尽残余乙醇,超净台吹干沉淀。
注:RNA沉淀不能过分干燥,否则不好溶解。
10. 贮存RNA:加入50-100 μl的RNase-free水(货号:RF001)溶解RNA,-80℃保存备用。
注意事项:
1、本产品仅供科研使用。请勿用于医药、临床诊断或治疗,食品及化妆品等用途。请勿存放于普通住宅区。
2、 为了您的安全和健康,请穿好实验服并佩戴一次性手套和口罩操作。