本试剂盒采用经典的碱裂解法裂解细菌,再通过离心吸附柱在高盐状态下特异性地结合DNA的特性,可以从1–5ml大肠杆菌LB培养液中快速提取3–20μg纯净的高拷贝质粒DNA。提取的质粒可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、连接和转化等实验。然而,对质粒纯度要求更高的转染实验(要求无内毒素),此试剂盒不能达到要求。另外,尽管该试剂盒可以抽提较大的质粒(>10kb),但我们不推荐使用。如果一定要使用,请参考以下方法:加大菌体使用量(使用5–10 ml过夜培养物),同时按照比例增加P1、P2、P3的用量;洗脱缓冲液应在70℃预热,在吸附和洗脱时可以适当的延长时间,以增加提取效率,其它步骤相同。
产品组成:
储存条件:在室温(25℃左右)干燥条件下,可保存1年;更长时间的保存可置于2–8℃。
使用说明:
使用前请先在漂洗液中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶体上的标签。溶液Ⅰ在使用前先加入RNaseA(将试剂盒中提供的 RNaseA 全部加入),混匀,置于 2-8℃保存。如非指明,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
操作步骤(仅供参考):
1、取 1-5mL 细菌培养物,12000rpm 离心 1min,尽量吸除上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。
2、向留有菌体沉淀的离心管中加入 250μL 溶液Ⅰ(请先检查是否已加入 RNaseA),使用移液器或旋涡振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀。注意:如果菌块未彻底混匀,会影响裂解导致质粒提取量和纯度偏低。
3、向离心管中加入 250μL 溶液Ⅱ,温和地上下翻转 6-8 次使菌体充分裂解。注意:混匀一定要温和,以免污染细菌基因组 DNA,此时菌液应变得清亮粘稠,作用时间不要超过 5 min,以免质粒受到破坏。
4、向离心管中加入 350μL 溶液Ⅲ,立即温和地上下翻转 6-8 次,充分混匀,此时会出现白色絮状沉淀。12000rpm 离心 10 min,用移液器小心地将上清转移到另一个干净的离心管中,尽量不要吸出沉淀。
注意:溶液Ⅲ加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
5、将上一步所得上清液加入吸附柱中(吸附柱加入收集管中),室温放置 2min,12000rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6、向吸附柱中加入 600μL 漂洗液Ⅰ(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm 离心 1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 700μL 漂洗液Ⅱ(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm 离心 1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
8、向吸附柱中加入 500μL 漂洗液Ⅱ,12000rpm 离心 1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
9、12000rpm 离心 2min,将吸附柱敞口置于室温或 50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续的实验如酶切、PCR 等。
10、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加 50-200μL 经 65℃水浴预热的洗脱液,室温放置 2min,12000rpm 离心 1min。
11、为了增加质粒的回收效率,可将得到的洗脱液重新加入吸附柱中,室温放置 2min,12000rpm离心 1min。
注意事项:
1、使用前请先检查溶液Ⅱ和溶液Ⅲ是否出现混浊,如有混浊现象,可在 37℃水浴中加热几分钟,待溶液恢复澄清后再使用。溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、漂洗液Ⅰ和漂洗液Ⅱ使用后应立即拧紧盖子。
2、洗脱缓冲液体积不应少于 50μL,体积过小影响回收效率;洗脱液的 pH 值对洗脱效率也有影晌,若需要用水做洗脱液应保证其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 将水的 pH 值调至此范围),pH 值低于 7. 0 会降低洗脱效率,DNA 产物应保存在-20℃,以防 DNA 降解。
3、 如果所提质粒为低拷贝质粒或大于 10kb 的大质粒,应加大菌体使用量,使用 5-10mL 过夜培养物,同时按照比例增加溶液Ⅰ、溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的用量,吸附和洗脱时可以适当的延长时间,以增加提取效率。
4、DNA 浓度及纯度检测:得到的质粒 DNA 纯度与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。得到的 DNA 可用琼脂糖疑胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。 DNA 应在 OD260处有显著吸收峰,OD260值为 1 相当于大约 50ug/mL 双链 DNA、 40ug/mL 单链 DNA。OD260/OD280比值应为 1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为 pH 值和离子存在会影响吸光值,但并不表示纯度低。