本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统提取细菌(革兰氏阳性菌和阴性菌)的基因组DNA。溶菌酶能有效去除细菌细胞壁;蛋白酶K能把核酸解离出来; RNaseA能去除痕量的RNA污染;离心吸附柱能够高效、专一吸附DNA,最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物,提取的基因组DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠。 使用本试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、Southern杂交等实验。
储存条件:在室温(25℃左右)干燥条件下保存
试剂盒组成:
提取得率:
准备工作:
1. 准备55℃和70℃水浴;无水乙醇;1.5ml灭菌离心管。
2. 按照标签所示在去蛋白液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3. 每次使用前请检查缓冲液GA,缓冲液GB和去蛋白液GD是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
操作步骤:
1、取细菌培养液 1ml,12000rpm 离心 1min.,尽量吸除上清。
2、向菌体中加入 200ul 溶液 A,振荡或用移液器吹打使菌体充分悬浮向悬浮液中加入 20ul 的RNase A (10mg/ml),充分颠倒混匀,室温放置 15-30min。
注意:如果是革兰氏阳性菌:可在第 2 步操作前用 200ul 终浓度为 20mg/ml 的溶菌酶 ,37 ℃处理 30 min 以上。(溶菌酶的缓冲液用:20 mM Tris, pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2% TritonX-100)
3、向管中加入 20ul 的蛋白酶 K(10mg/ml),充分混匀,55℃消化 30-60min,消化期间可颠倒离心管混匀数次,直至样品消化完全为止,此时可见菌液呈清亮粘稠状。
4、向管中加入 200ul 溶液 B,充分颠倒混匀,如出现白色沉淀,可于 75℃放置 15-30min,沉淀即会消失,不影响后续实验。如果溶液未变清亮,说明样品消化不彻底,可能会导致 DNA的提取量以及纯度降低,还可能堵塞吸附柱。
5、向管中加入 200ul 无水乙醇,充分混匀,此时还可能会出现絮状沉淀,不影响 DNA 的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入到吸附柱中,静置 2min。
6、12000rpm 离心 2min. 弃废液,将吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液(使用前请先检查是否己加入无水乙醇)。12000rpm 离心 1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
8、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液, 12000rpm 离心 l min, 弃废液,将吸附柱放入收集管中。
9、12000rpm 离心 2min,将吸附柱敞口置于室温或 50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续实验如酶切、PCR 等。
10、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加 50-200ul 经 65℃水浴预热的洗脱液,室温放置 5min,12000rpm 离心 1min。
11、离心所得洗脱液再加入吸附柱中,室温放置 2min ,12000rpm 离心 2 min,即可得到高质量的细菌基因组 DNA。
注意事项:
1、样品应避免反复冻融,否则会导致提取的 DNA 片段较小且提取量下降。
2、若试剂盒中的溶液出现沉淀,可在 65℃水浴中重新溶解后再使用,不影响提取效果。
3、如果实验中的离心步骤出现柱子堵塞的情况,可适当延长离心时间。
4、洗脱缓冲液的体积最好不少于 50ul,体积过小会影响回收效率;洗脱液的 pH 值对洗脱效率也有影响,若需要用水做洗脱液应保证其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 将水的 pH 值调至此范围), pH 值低于 7. 0 会降低洗脱效率。DNA 产物应保存在-20℃,以防 DNA 降解。
5、 DNA 浓度及纯度检测:得到的基因组 DNA 片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。 回收得到的 DNA 片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。DNA 应在 OD260处有显著吸收峰,OD260值为 1.0 相当于大约 50μg/ml 双链 DNA、40μg/ml单链 DNA。OD260/0D280比值应为 1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为 pH 值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
6.所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。